List Artikel
-
Pembelajaran Mesin dan RNAseq untuk Deteksi Gen Diferensial
Kemajuan dalam teknologi sekuensing RNA (RNA-seq) telah memberikan wawasan mendalam mengenai ekspresi gen dan mekanisme biologis yang mendasarinya. Metode tersebut dengan kemampuan resolusi tinggi dan efisiensi biaya telah menjadi alat utama dalam studi transkriptom. Meskipun kontrol kualitas diterapkan di berbagai tahap, keterbatasan dalam desain eksperimen dan analisis data sering kali menciptakan bias. Hal tersebut menyebabkan…
-
DeepBGC Pendekatan Deep Learning dalam Deteksi Klaster Gen Biosintetik
Kemajuan teknologi dalam bidang bioinformatika telah membuka peluang besar untuk mengeksplorasi produk alami mikroorganisme sebagai sumber utama dalam pengembangan obat. Produk-produk alami ini, yang merupakan metabolit sekunder mikroba, diatur oleh kumpulan gen yang terorganisir dalam klaster gen biosintetik (Biosynthetic Gene Clusters/BGC). Identifikasi BGC telah menjadi fokus utama karena perannya dalam menghasilkan molekul bioaktif yang berpotensi…
-
Klasifikasi Antarmuka Protein dengan Pembelajaran Mesin
Interaksi protein-protein (PPI) merupakan komponen mendasar dari berbagai proses biologis yang terjadi di dalam sel, seperti regulasi metabolisme, sinyal transduksi, dan replikasi DNA. Studi mendalam mengenai antarmuka PPI dapat memberikan wawasan mengenai kinetika, termodinamika, dan fungsi molekuler kompleks protein, serta mengungkapkan peran mereka dalam berbagai penyakit. Pengetahuan ini membuka peluang untuk mengembangkan target terapeutik baru.…
-
Revolusi Machine Learning dalam Identifikasi Mutasi Genetik
Kemajuan dalam teknologi machine learning telah membuka peluang besar dalam memahami dan mengidentifikasi mutasi genetik yang relevan dengan berbagai penyakit. Penelitian di bidang ini menawarkan pendekatan baru yang lebih efisien dalam menganalisis data genom yang sangat kompleks dan berukuran besar. Dalam beberapa dekade terakhir, kemajuan dalam pengurutan genom menghasilkan data yang sangat besar, yang sulit…
-
Prediksi Struktur Protein 3D dan Fungsi dengan Algoritma Deep Learning
Perkembangan teknologi kecerdasan buatan (Artificial Intelligence/AI) telah membuka peluang besar dalam bidang bioinformatika, terutama melalui penerapan algoritma deep learning. Salah satu aplikasi penting yang sedang berkembang pesat adalah prediksi struktur tiga dimensi (3D) protein dan analisis fungsinya. Pemahaman yang mendalam mengenai struktur protein 3D sangatlah penting karena struktur tersebut menentukan bagaimana protein berinteraksi dengan molekul…
-
Identifikasi Data dan Machine Learning dalam Bioinformatika dan Biodiversitas
Bioinformatika dan biodiversitas adalah dua bidang yang semakin beririsan seiring dengan kemajuan teknologi informasi dan analisis data. Bioinformatika, yang berfokus pada penerapan teknologi komputasi untuk memahami data biologis, dan biodiversitas, yang mempelajari variasi kehidupan di berbagai tingkat, sama-sama memanfaatkan berbagai jenis data untuk mendukung penelitian dan pengambilan keputusan. Dalam konteks ini, machine learning menjadi salah…
-
Analisis Metabolit Plasma Serum dan Darah Utuh Menggunakan Spektroskopi 1H NMR
Spektroskopi resonansi magnetik inti (NMR) telah menjadi salah satu teknik utama dalam analisis metabolomik, khususnya untuk pengujian metabolit dalam plasma, serum, dan darah utuh. Teknik ini menawarkan keunggulan dalam hal non-destruktif, kebutuhan sampel yang minimal, dan kemampuan untuk mendeteksi berbagai senyawa metabolit secara simultan. Kajian ini bertujuan untuk menganalisis metabolit dalam tiga jenis matriks biologis…
-
Revolusi Genom Poligenik Manusia
Kemajuan dalam teknologi pengeditan gen telah membawa umat manusia ke ambang era baru dalam ilmu kedokteran. Salah satu perkembangan mutakhir yang menjadi perhatian dunia ilmiah adalah pengeditan genom poligenik. Penelitian yang dipublikasikan dalam Nature oleh Peter M. Visscher dan koleganya menunjukkan potensi signifikan dari teknologi ini dalam mengurangi risiko sejumlah penyakit genetik pada manusia, seperti…
-
Peran Gaya Van der Waals dalam Revolusi Docking Molekuler
Interaksi molekuler merupakan salah satu konsep fundamental dalam kimia dan biologi yang memainkan peran penting dalam berbagai fenomena alamiah dan aplikasi teknologi. Salah satu teori penting yang mendasari pemahaman interaksi molekuler adalah gaya Van der Waals. Gaya ini, meskipun relatif lemah dibandingkan dengan ikatan kovalen atau ionik, memiliki pengaruh yang signifikan dalam stabilitas dan interaksi…
-
Pemodelan Interaksi Protein dan Ligan untuk Revolusi Pengembangan Obat
Docking molekuler merupakan salah satu metode komputasi yang sangat penting dalam bidang bioinformatika dan kimia komputasi, khususnya dalam konteks pemodelan interaksi antara protein dan ligan. Teknologi ini memainkan peran kunci dalam pengembangan obat modern dengan menawarkan pendekatan yang efisien untuk memprediksi bagaimana molekul kecil, seperti ligan, dapat berinteraksi dengan protein target. Pemahaman yang mendalam terhadap…