Swiss Target Prediction

MABBI – SwissTargetPrediction merupakan sebuah server web untuk secara akurat memprediksi target molekul bioaktif berdasarkan kombinasi pengukuran kesamaan 2D dan 3D dengan ligan yang diketahui. Alat ini membandingkan molekul kueri dengan perpustakaan berisi 280.000 senyawa yang aktif pada lebih dari 2.000 target dari 5 organisme berbeda. Molekul kecil bioaktif seperti obat atau metabolit, berikatan dengan protein atau target makromolekul lainnya untuk memodulasi aktivitasnya yang pada gilirannya menghasilkan efek fenotipik yang diamati. Untuk alasan ini, memetakan target molekul kecil bioaktif adalah langkah kunci untuk mengungkap mekanisme molekuler yang mendasari bioaktivitasnya dan memprediksi potensi efek samping atau reaktivitas silang. Baru-baru ini, dataset besar dari interaksi protein-molekul kecil telah tersedia, menyediakan sumber informasi yang unik untuk pengembangan pendekatan berbasis pengetahuan untuk secara komputasi mengidentifikasi target baru untuk molekul yang tidak dikarakterisasi atau target sekunder untuk molekul yang diketahui. Prediksi dapat dilakukan dalam lima organisme yang berbeda, dan prediksi pemetaan dengan homologi di dalam dan di antara spesies yang berbeda dimungkinkan untuk paralog dan ortholog yang dekat. SwissTargetPrediction dapat diakses secara gratis dan tanpa persyaratan login di http://www.swisstargetprediction.ch (Tri/MABBI)