.NET Bio dari Microsoft Biology Foundation

MABBI – .NET Bio pada awalnya dibuat dan dirilis oleh Microsoft Research dengan nama Microsoft Biology Foundation (MBF) dan kemudian dikemas ulang dan dirilis oleh Outercurve Foundation sebagai proyek publik dan sumber terbuka sepenuhnya di bawah Lisensi Apache 2.0. .NET Bio adalah pustaka bioinformatika dan genomik open source yang dibuat untuk memungkinkan pemuatan, penyimpanan, dan analisis data biologis yang sederhana. Itu dirancang untuk .NET Standard 2.0 dan merupakan bagian dari Microsoft Biology Initiative di divisi eScience. 

Pustaka terdiri dari kumpulan kelas objek yang dituju yang ditulis dalam C# untuk melakukan tugas bioinformatik umum seperti: Baca dan tulis urutan standar dan urutan data file seperti FASTA dan GenBank; Akses layanan web online seperti NCBI BLAST untuk mencari database yang dikenal untuk urutan fragmen; Algoritma untuk keberpihakan lokal dan global; Algoritma untuk sequence assembly , termasuk implementasi assembler DeNovo paralel; Meskipun perpustakaan itu sendiri ditulis dalam C#, itu dapat digunakan dari bahasa apa pun yang kompatibel dengan .NET dan memiliki berbagai contoh penggunaan termasuk dari skrip IronPython. (Tri/MABBI)


Posted

in

by

Comments

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *