MABBI – Proyek Biokonduktor adalah inisiatif untuk pembuatan perangkat lunak kolaboratif yang dapat dikembangkan untuk pemrosesan biologi dan bioinformatika. Tujuan dari proyek ini meliputi: mendorong pengembangan kolaboratif dan memperluasnya penggunaan perangkat lunak inovatif, mengurangi hambatan masuk ke dalam penelitian ilmiah interdisipliner, dan mempromosikan permintaan reproduktifitas jarak jauh dari hasil penelitian. Proyek Biokonduktor adalah inisiatif untuk pembuatan perangkat lunak kolaboratif yang dapat diperluas untuk pemrosesan biologi dan bioinformatika (CBB). Biologi, khususnya biologi molekuler, sedang mengalami dua transformasi terkait. Pertama, tumbuhnya kesadaran akan mengubah sifat dari banyak proses biologi dan bahwa model diproses dan statistik dapat digunakan untuk mendapatkan manfaat yang besar. Kedua, perkembangan dalam perolehan data throughput tinggi menghasilkan persyaratan untuk pemrosesan kecanggihan dan statistik pada setiap tahap jalur penelitian biologi. Tujuan utama dari proyek Bioconductor adalah menciptakan lingkungan pengembangan dan penyebaran perangkat lunak yang tahan lama dan fleksibel yang memenuhi tantangan, pemrosesan, dan inferensial baru ini. Kami berusaha keras untuk mengurangi hambatan masuk ke penelitian di CBB.
Di antara banyak tantangan yang muncul untuk ahli statistik dan ahli biologi adalah tugas perolehan data, pengelolaan data, transformasi data, pemodelan data, menggabungkan sumber data yang berbeda, memanfaatkan metode pembelajaran mesin yang terus berkembang, dan mengembangkan pemodelan strategi baru yang cocok untuk CBB. Kami telah menekan transparansi, reproduktifitas, dan efisiensi pengembangan dalam menghadapi tantangan ini. Hal mendasar dari semua tugas ini adalah kebutuhan akan perangkat lunak; ide saja tidak dapat menyelesaikan masalah substansial yang muncul. Motivasi utama untuk lingkungan pemrosesan sumber terbuka untuk statistik genomik adalah transparansi, pengejaran reproduktifitas, dan efisiensi pengembangan. (Tri/MABBI)
Leave a Reply