Krisis keanekaragaman hayati yang melibatkan penurunan populasi serangga telah menjadi perhatian utama dalam kajian konservasi global dalam satu dekade terakhir. Penurunan ini bukan sekadar fluktuasi alami, melainkan mencerminkan gangguan yang serius terhadap struktur ekosistem dan fungsi ekologis yang mereka dukung, mulai dari penyerbukan hingga daur ulang nutrisi. Berbagai penelitian telah menunjukkan bahwa banyak taksa serangga, seperti capung, lebah, kumbang pengurai kayu (saproksilik), dan kupu-kupu mengalami tekanan populasi yang drastis akibat kombinasi faktor seperti kehilangan habitat, penggunaan pestisida, perubahan iklim, dan polusi.
Meskipun banyak inisiatif konservasi telah dilaksanakan untuk melindungi kelompok serangga ini, masih terdapat kekurangan mendasar dalam pemahaman terhadap pola spasial genetik dan sejarah evolusioner mereka. Kesenjangan ini secara signifikan menghambat efektivitas upaya konservasi karena strategi yang tidak didasarkan pada data evolusioner dan struktur populasi dapat gagal dalam mempertahankan ketahanan jangka panjang spesies.
Dalam konteks ini, data genetik menjadi alat krusial untuk menjembatani kekosongan informasi tersebut. Melalui informasi genetik, para peneliti dapat mengungkap tingkat keragaman dalam dan antar populasi, mengidentifikasi unit-unit evolusioner yang penting untuk konservasi, serta merekonstruksi sejarah filogenetik yang menjadi dasar bagi penentuan prioritas konservasi. Dengan semakin berkembangnya teknologi sekuensing dan tersedianya sumber data publik, kini terdapat peluang besar untuk memanfaatkan arsip genetik global guna mengisi kekosongan pengetahuan yang telah lama ada. Repositori data seperti GenBank (Genetic Sequence Database) dan BOLD (Barcode of Life Data System) menyimpan jutaan sekuens DNA yang telah dikumpulkan dari berbagai spesies di seluruh dunia, lengkap dengan metadata mengenai taksonomi dan lokasi pengumpulan. Kendati demikian, pemanfaatan data ini seringkali terhambat oleh permasalahan seperti kurangnya standardisasi protokol pengambilan sampel, informasi lokasi yang tidak lengkap, hingga inkonsistensi taksonomi.
Serena Baini dan Alessio De Biase dalam studi terbaru mereka yang berjudul “Filling knowledge gaps in insect conservation by leveraging genetic data from public archives” menyoroti secara spesifik bagaimana potensi besar dari arsip genetik publik dapat dimanfaatkan untuk memperkuat basis data konservasi serangga di Italia. Dengan berfokus pada spesies yang telah tercantum dalam Daftar Merah Persatuan Internasional untuk Konservasi Alam (International Union for Conservation of Nature/IUCN) versi Italia, penelitian ini bertujuan untuk menciptakan suatu dataset terkurasi yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi celah data, melakukan analisis spasial, serta memperkuat strategi konservasi berbasis bukti.
Dalam pendekatan mereka, Baini dan De Biase secara sistematis mengekstraksi data genetik dari GenBank dan BOLD untuk empat kelompok serangga prioritas, yakni capung, lebah, kumbang saproksilik, dan kupu-kupu. Data yang dikumpulkan tidak hanya berupa sekuens DNA mitokondria, melainkan juga mencakup metadata yang menyertainya seperti klasifikasi taksonomi, lokasi pengumpulan, koordinat geografis, dan status konservasi berdasarkan daftar IUCN nasional. Setelah melalui proses kontrol kualitas dan standardisasi data, mereka berhasil menyusun sebuah basis data yang mencakup lebih dari tiga puluh tiga ribu sekuens mitokondria dari seribu empat ratus enam puluh enam spesies serangga.
Kekuatan utama dari dataset ini terletak pada kurasi dan georeferensi yang cermat, memungkinkan para peneliti untuk mengidentifikasi distribusi spasial spesies berdasarkan informasi genetis. Dengan mengintegrasikan data sekuens dengan koordinat geografis, studi ini memfasilitasi analisis komparatif yang sebelumnya sulit dilakukan akibat tersebarnya data dalam format yang tidak terstandar. Selain itu, penggabungan data dari dua sumber besar, yaitu GenBank dan BOLD, menjadikan kumpulan data ini representatif dan komprehensif dalam lingkup nasional Italia. Hasil yang diperoleh tidak hanya menunjukkan sebaran data berdasarkan kelompok serangga, tetapi juga mengungkapkan adanya ketimpangan dalam representasi spesies tertentu yang sangat terbatas datanya. Fenomena ini mengindikasikan bahwa sebagian besar spesies yang masuk dalam kategori konservasi kritis di Daftar Merah IUCN masih sangat kurang terdokumentasi secara genetis.
Masalah keterbatasan data ini memberikan implikasi yang besar terhadap strategi konservasi. Tanpa informasi mengenai variasi genetik intra-spesies atau hubungan filogenetik antar spesies, konservasi yang dilakukan cenderung bersifat homogen dan berisiko mengabaikan entitas genetik penting yang mungkin memiliki adaptasi lokal atau nilai evolusioner yang tinggi. Oleh karena itu, penelitian ini tidak hanya berfungsi sebagai inventaris data, tetapi juga sebagai peta jalan (roadmap) untuk mengidentifikasi kebutuhan mendesak dalam pengumpulan data lapangan maupun pengarsipan data di masa depan. Salah satu contoh yang disorot dalam studi ini adalah minimnya data koordinat geografis yang terhubung dengan sekuens genetik, yang sangat menyulitkan pemetaan distribusi spasial dan analisis filogeografis. Dalam hal ini, Baini dan De Biase menekankan pentingnya konsistensi dalam dokumentasi metadata selama pengumpulan sampel.
Lebih lanjut, studi ini membuka peluang yang luas untuk repurposing atau pemanfaatan ulang data dalam berbagai bidang terkait. Di antaranya adalah studi filogeografi, yaitu analisis distribusi geografis garis keturunan genetik, serta makrogenetika, yakni studi skala besar tentang pola keragaman genetik lintas spesies atau komunitas. Kedua bidang ini memiliki potensi besar dalam memajukan strategi konservasi berbasis bukti karena mampu menyoroti area dengan nilai konservasi tinggi berdasarkan keragaman genetik, bukan semata berdasarkan jumlah spesies. Selain itu, data ini juga dapat digunakan untuk mendukung studi perubahan iklim dengan mengkaji pergeseran distribusi genetik sebagai respons terhadap perubahan lingkungan.
Sebagai kontribusi nyata terhadap keterbukaan data ilmiah, database yang dikembangkan oleh Baini dan De Biase tersedia secara publik dalam format Structured Query Language (SQL) melalui repositori Zenodo. Format ini memungkinkan fleksibilitas tinggi bagi peneliti untuk mengintegrasikan data ke dalam platform analitik masing-masing, serta mengembangkan skrip kueri yang disesuaikan untuk menjawab pertanyaan-pertanyaan ilmiah tertentu. Ketersediaan data dalam format terstandar dan terbuka juga mencerminkan praktik terbaik dalam ilmu data biodiversitas modern, yang mendorong kolaborasi lintas disiplin dan meningkatkan transparansi metodologi.
Meskipun kontribusi studi ini sangat penting, penulis tetap mengakui adanya keterbatasan metodologis, terutama terkait bias spasial dalam data arsip. Sebagian besar data genetik yang tersedia berasal dari lokasi yang relatif mudah dijangkau atau telah menjadi fokus penelitian sebelumnya, sehingga menciptakan “cold spots” atau area kosong data yang bisa jadi justru menyimpan keanekaragaman genetik tersembunyi. Oleh karena itu, strategi pengambilan sampel yang lebih sistematis dan representatif secara geografis perlu dirancang untuk menutup kekosongan ini. Di samping itu, kualitas dan akurasi taksonomi dalam database publik seringkali menjadi tantangan tersendiri, mengingat perubahan nomenklatur atau kekeliruan identifikasi spesimen yang dapat menyebabkan distorsi dalam analisis.
Dalam kesimpulannya, penelitian oleh Serena Baini dan Alessio De Biase memperlihatkan bagaimana pendekatan berbasis data genetik dapat secara signifikan memperkaya pemahaman tentang keanekaragaman serangga dan meningkatkan efektivitas konservasi. Dengan memanfaatkan arsip genetik publik yang dikurasi dan dianalisis secara menyeluruh, mereka berhasil menyusun basis data yang mendukung analisis lintas taksa dan lokasi, sekaligus mengidentifikasi celah informasi yang masih harus diatasi.
Studi ini menekankan bahwa konservasi berbasis genetik bukan lagi wacana masa depan, tetapi sudah menjadi kebutuhan mendesak dalam konteks hilangnya keanekaragaman serangga secara global. Penguatan kapasitas nasional untuk menyumbang dan memanfaatkan data genetik dalam platform publik, serta peningkatan kualitas metadata dan taksonomi, akan menjadi langkah kunci dalam mempercepat transformasi konservasi serangga dari berbasis asumsi menuju berbasis data ilmiah yang akurat dan terbuka.
Sumber:
Leave a Reply