Category: Bacteria and Virus
-
Potensi Arogyamrita Kwath sebagai Agen Anti Inflamasi dan Antivirus
Arogyamrita Kwath, sebuah ramuan polih herbal yang berasal dari tradisi pengobatan Ayurveda, telah dikenal luas karena kemampuannya dalam menangani berbagai masalah kesehatan, terutama yang terkait dengan peradangan dan infeksi virus. Penelitian yang dilakukan oleh Akash Dey, Akash G. Kendre, Madhu Babu Dande, Yogita B. Tandalekar, Shreyanshi Kulshreshtha, Amit Srivastava, Alok Goyal, Ramadas Maganti, Sumit Srivastava,…
-
Filogeografi dan Evolusi Watermelon Mosaic Virus
Watermelon mosaic virus (WMV) merupakan salah satu patogen penting yang menyerang berbagai tanaman, terutama dari famili Cucurbitaceae dan Leguminosae. Virus ini memiliki distribusi global dan telah menyebabkan kerugian ekonomi yang signifikan di sektor pertanian. Penelitian mengenai filodinamika dan filogeografi WMV memberikan wawasan mendalam tentang evolusi, keragaman genetik, dan pola penyebaran virus ini, yang esensial untuk…
-
Prediksi Efektor Tipe IV Bakteri dengan Model Bahasa Protein
Bakteri patogen memiliki berbagai strategi untuk menginfeksi sel inang dan menyebabkan penyakit. Salah satu mekanisme utama yang digunakan oleh bakteri patogen adalah sistem sekresi tipe IV (Type IV Secretion Systems/T4SS), yang memungkinkan transfer protein efektor tipe IV (Type IV Secreted Effectors/T4SE) ke dalam sel inang. Protein efektor ini memiliki peran penting dalam memodulasi jalur sinyal…
-
Jaringan Interaksi Protein Moorella thermoacetica untuk Optimasi Bioteknologi
Pemahaman mendalam terhadap interaksi protein-protein dalam sistem biologis telah menjadi bidang penelitian yang berkembang pesat, terutama dalam konteks mikroorganisme dengan potensi aplikasi industri. Salah satu mikroorganisme yang menarik perhatian adalah Moorella thermoacetica, sebuah bakteri anaerob termofilik yang memiliki kemampuan unik dalam mengonversi karbon dioksida (CO₂) dan karbon monoksida (CO) menjadi asetat melalui jalur Wood-Ljungdahl. Kemampuan…
-
Prediksi Interaksi circRNA Protein dengan Deep Learning
Penelitian terbaru mengenai interaksi antara circular RNA (circRNA) dan protein telah menarik perhatian signifikan dalam bidang biologi molekuler. Artikel berjudul “A brief survey of deep learning-based models for CircRNA-protein binding sites prediction” yang diterbitkan di ScienceDirect memberikan tinjauan singkat tentang model pembelajaran mendalam yang digunakan untuk memprediksi interaksi tersebut. circRNA adalah molekul RNA yang membentuk…
-
Analisis Genetik Virus Miokarditis Ikan pada Salmon Atlantik di Kepulauan Faroe
Penyakit sindrom miokarditis (CMS) yang disebabkan oleh virus miokarditis ikan (PMCV) merupakan masalah serius dalam budidaya salmon Atlantik (Salmo salar L.). Sejak kemunculan kembali CMS di Kepulauan Faroe pada tahun 2013, jumlah wabah CMS yang dilaporkan terus meningkat. Namun, keragaman genetik PMCV, jalur transmisi, dan trajektori evolusinya masih belum sepenuhnya dipahami. Penelitian ini bertujuan untuk…
-
Prediksi Struktur dan Fungsi NSP4B Virus Zika
Virus Zika (ZIKV) merupakan salah satu virus yang termasuk dalam keluarga Flaviviridae dan genus Flavivirus, dengan penyebaran yang signifikan di berbagai wilayah tropis dan subtropis. Penyakit yang ditimbulkan oleh virus ini sering kali bersifat asimtomatik atau menyebabkan gejala ringan, namun dalam beberapa kasus dapat berakibat serius, terutama pada wanita hamil karena berpotensi menyebabkan mikrosefali pada…
-
Identifikasi Cepat Inang Gen Resistensi Antibiotik melalui Prescreening Pembacaan Metagenomik
Penyebaran gen resistensi antibiotik (Antibiotic Resistance Genes/ARGs) dan bakteri resisten antibiotik (Antibiotic-Resistant Bacteria/ARB) telah menjadi ancaman serius bagi kesehatan global. Overuse dan penyalahgunaan antibiotik mendorong proliferasi ARGs melalui transfer gen horizontal (Horizontal Gene Transfer/HGT), mempercepat munculnya ARB di berbagai lingkungan. Identifikasi cepat inang ARGs esensial untuk memahami dinamika penyebaran resistensi dan mengembangkan strategi mitigasi yang…
-
Evolusi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis di Meksiko
Tuberkulosis (TB) masih menjadi permasalahan kesehatan global yang memerlukan perhatian serius. Penyakit ini disebabkan oleh Mycobacterium tuberculosis (MTB), yang memiliki variasi genetik yang berkontribusi pada patogenisitas dan resistensi terhadap obat. Di Meksiko, informasi mengenai sebaran genotip MTB yang mendominasi serta karakteristik genetik yang terkait dengan resistensi obat masih terbatas. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan…