Category: Biodiversity
-
Keragaman Genetik dan Konservasi Allium galanthum di Xinjiang
Allium galanthum adalah spesies tanaman liar yang memiliki nilai penting dalam ketahanan pangan dan pemuliaan bawang (Allium cepa L.). Penelitian terbaru mengungkapkan keragaman genetik dan struktur populasi A. galanthum di Xinjiang, Tiongkok, serta konstruksi koleksi inti yang dapat mendukung konservasi dan pengelolaan sumber daya genetiknya. Menggunakan metode genotyping-by-sequencing (GBS), penelitian ini menganalisis 129 individu A.…
-
Adaptasi Molekuler Procambarus clarkii terhadap Paparan Pestisida
Spesies invasif memiliki kemampuan adaptasi yang tinggi terhadap kondisi lingkungan yang ekstrem, termasuk lingkungan yang tercemar. Procambarus clarkii atau crayfish merah, telah menunjukkan kemampuan untuk bertahan hidup dalam berbagai kondisi lingkungan, termasuk habitat dengan paparan pestisida. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis respons molekuler dan fisiologis dari tiga populasi P. clarkii yang berasal dari lingkungan dengan…
-
Waterlogging dan Kombinasi Stres Abiotik Mengubah Metabolisme Akar dan Mikroba Rizosfer Arabidopsis thaliana
Waterlogging (genangan air) merupakan salah satu tantangan utama dalam pertumbuhan tanaman, yang sering terjadi bersamaan dengan stres abiotik lainnya seperti suhu ekstrem dan salinitas. Penelitian ini menyelidiki dampak waterlogging, baik secara tunggal maupun dalam kombinasi dengan stres panas, dingin, dan salinitas, terhadap metabolisme akar, eksudasi akar, serta komunitas mikroba rizosfer pada Arabidopsis thaliana. Analisis metabolomik…
-
Identifikasi Singlet dan Evaluasi Algoritma Duplet dalam scRNAseq dengan Kode Batang DNA Sintetis
Kemajuan teknologi Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) telah memungkinkan analisis ekspresi gen dengan resolusi tinggi, tetapi keberadaan duplet dapat mengganggu interpretasi data. Kode batang DNA sintetis telah dikembangkan sebagai metode inovatif untuk mengidentifikasi sel tunggal (singlet) dalam dataset scRNA-seq dan mengevaluasi algoritma deteksi duplet. Penelitian ini memperkenalkan singletCode, sebuah kerangka kerja berbasis kode batang DNA yang…
-
Visualisasi Metagenomik dan Metatranskriptomik untuk Analisis Komunitas Mikroba
Metagenomik dan metatranskriptomik merupakan pendekatan yang sangat penting dalam mengungkap keanekaragaman mikroba dan dinamika ekspresi gen dalam lingkungan yang kompleks. Namun, besarnya volume data yang dihasilkan menimbulkan tantangan dalam pengolahan, analisis, dan interpretasi. Visualisasi data memegang peranan sentral dalam mempermudah pemahaman struktur komunitas mikroba serta fungsi biologi yang terlibat. Artikel ini mengulas secara komprehensif berbagai…
-
Evolusi Genomik SARS CoV 2 di Maroko dan Dinamika Variasi Genetik
Sejak pertama kali diidentifikasi pada akhir 2019, sindrom pernapasan akut berat corona virus 2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2/SARS-CoV-2) telah mengalami evolusi yang signifikan, menghasilkan berbagai varian dengan tingkat infektivitas dan resistensi imun yang berbeda. Studi ini bertujuan untuk menganalisis evolusi genomik SARS-CoV-2 di Maroko berdasarkan urutan genom lengkap yang dikumpulkan dari tahun 2020…
-
Estimasi Kelembaban Daun dengan Model Empiris dan Pembelajaran Mesin
Kelembaban daun merupakan faktor kritis dalam epidemi penyakit tanaman, terutama dalam ekosistem yang mengalami gradien iklim. Studi ini membandingkan efektivitas model empiris dengan metode pembelajaran mesin untuk memperkirakan durasi kelembaban daun di lanskap liar. Menggunakan data meteorologi dari berbagai stasiun cuaca serta pencitraan drone, penelitian ini mengevaluasi bagaimana kelembaban daun berkorelasi dengan kondisi mikroklimat serta…
-
Metabarkoding eDNA untuk Biodiversitas Eukariotik di Zona Es Marginal Selat Fram Arktik
Perubahan iklim telah memberikan dampak signifikan terhadap ekosistem laut, terutama di wilayah Samudra Arktik yang sensitif terhadap peningkatan suhu dan hilangnya es laut. Penurunan habitat es laut mempengaruhi produksi primer dan dinamika komunitas biota laut, terutama di zona es marginal (Marginal Ice Zone/MIZ). MIZ merupakan ekosistem yang sangat dinamis dan berfungsi sebagai zona transisi antara…