Category: Database Genome
-
Resistensi Aeromonas dari Perairan ke Ancaman Kesehatan
Peningkatan prevalensi bakteri resisten terhadap antibiotik telah menjadi tantangan kesehatan global yang serius, dan salah satu genus bakteri yang kini mendapat perhatian khusus adalah Aeromonas. Genus ini terdiri dari bakteri gram negatif yang banyak ditemukan di lingkungan perairan dan memiliki kemampuan patogenik yang tinggi, baik pada hewan akuatik maupun manusia. Kajian terbaru yang dilakukan oleh…
-
Menjelaskan Kecerdasan Buatan dalam Bioinformatika
Kecerdasan buatan atau artificial intelligence telah membawa revolusi besar dalam bidang bioinformatika, khususnya dalam pengolahan dan interpretasi data biologis berskala besar. Namun, kemajuan ini tidak serta-merta menjamin pemahaman yang utuh terhadap proses pengambilan keputusan yang dilakukan oleh sistem-sistem tersebut. Seiring meningkatnya adopsi teknologi pembelajaran mesin dalam bioinformatika, kebutuhan akan transparansi dan keterjelasan algoritma menjadi semakin…
-
Shotgun eDNA Udara Ungkap Genetika Bioma
Revolusi dalam pemantauan keanekaragaman hayati kini semakin nyata dengan hadirnya teknologi shotgun sequencing terhadap deoxyribonucleic acid lingkungan (environmental DNA/eDNA) yang diperoleh dari udara. Metode ini memungkinkan deteksi organisme secara menyeluruh tanpa harus menangkap atau mengamati langsung individu di lapangan. Melalui pendekatan ini, para ilmuwan mampu menilai struktur bioma, komposisi komunitas spesies, variasi genom, hingga dinamika…
-
Rafflesia Terancam Punah di Hutan Asia Tenggara
Rafflesia, genus tumbuhan berbunga terbesar di dunia, kini menghadapi krisis kelestarian yang mendalam. Dengan kelopak raksasa yang menakjubkan dan struktur reproduktif unik, tanaman ini tidak hanya menarik secara biologis tetapi juga memiliki nilai simbolik sebagai ikon keanekaragaman hayati tropis. Namun, kajian terbaru menunjukkan bahwa sebagian besar spesies dalam genus Rafflesia saat ini berada di ambang…
-
Genom Magnolia sinica untuk Konservasi Spesies Langka
Pemahaman terhadap keragaman genetik suatu spesies menjadi sangat penting dalam konteks konservasi keanekaragaman hayati, terlebih ketika spesies tersebut termasuk dalam kategori dengan jumlah populasi yang sangat kecil di alam. Magnolia sinica, salah satu anggota famili Magnoliaceae, merupakan contoh nyata dari spesies tumbuhan yang masuk dalam kelompok Plant Species with Extremely Small Populations atau spesies tumbuhan…
-
Virome Lingkungan dan Feses dalam Perbandingan Protokol Metagenomik
Analisis virome (virome analysis) telah menjadi pendekatan utama dalam studi virologi lingkungan dan mikrobioma manusia karena mampu mengungkap keragaman virus yang tersembunyi dalam berbagai jenis sampel, termasuk feses dan matriks lingkungan seperti air, tanah, serta permukaan buatan. Dalam upaya memahami indikator kontaminasi fekal serta potensi transmisi patogen di lingkungan, penelitian terbaru memberikan gambaran penting tentang…
-
Prediksi Gen Resistensi Tebu Poliploid dengan DaapNLRSeek
Pemanfaatan pendekatan bioinformatika berbasis kecerdasan buatan dalam analisis prediksi gen resistensi pada tanaman tebu poliploid menunjukkan tonggak penting dalam pengembangan pertahanan genetik tanaman terhadap patogen. Melalui penelitian berjudul DaapNLRSeek, prediction and evolution of resistance genes in polyploid sugarcane genomes, Huang dan kolega memperkenalkan DaapNLRSeek, sebuah platform prediksi berbasis data yang dirancang khusus untuk mengidentifikasi dan…
-
Kecerdasan Buatan dalam Penelitian Biodiversitas Perairan
Kemajuan teknologi kecerdasan buatan telah memberikan kontribusi signifikan dalam berbagai bidang ilmu, termasuk dalam penelitian biodiversitas akuatik . Artikel yang ditulis oleh Tymoteusz Miller dan rekan-rekannya mengevaluasi secara sistematis bagaimana kecerdasan buatan dimanfaatkan dalam riset biodiversitas perairan, dengan menggunakan metode ulasan sistematis berbasis PRISMA . Kajian ini menjadi sangat penting karena menyatukan berbagai pendekatan mutakhir…
-
Keanekaragaman Genetik Gymnocypris firmispinatus untuk Konservasi Berbasis Genom
Keanekaragaman genetik menjadi pilar penting dalam keberlanjutan spesies ikan air tawar, khususnya bagi Gymnocypris firmispinatus yang endemik di perairan dataran tinggi. Dalam konteks pengelolaan sumber daya hayati dan konservasi, pemahaman menyeluruh terhadap variasi genetik baik pada populasi liar, populasi indukan sumber , maupun populasi indukan sangat krusial untuk menghindari penurunan keragaman dan risiko inbreeding yang…
-
Genom Populasi Jawa Barat Ungkap Variasi Genetik Baru
Dalam lanskap penelitian genetika populasi global, Indonesia sebagai negara kepulauan dengan keragaman etnis yang tinggi masih menghadapi keterbatasan data genomik, khususnya dari populasi lokal yang belum banyak dieksplorasi. Studi terbaru tentang pengurutan seluruh genom atau dari populasi Jawa Barat menjadi tonggak penting dalam membuka tabir variasi genetik baru yang sebelumnya belum terdeteksi. Melalui pendekatan berbasis…